RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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HOXA11-201ENST00000006015 A0A1B0GTH6 734 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA11-201ENST00000006015 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA11-201ENST00000006015 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA11-201ENST00000006015 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA11-201ENST00000006015 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA11-201ENST00000006015 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXA11-201ENST00000006015 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.34■■□□□ 1.17
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HOXA11-201ENST00000006015 SLC35F6Q8N357 371 aa22.32■■□□□ 1.16
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HOXA11-201ENST00000006015 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.32■■□□□ 1.16
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HOXA11-201ENST00000006015 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 ATP2B1P20020 1258 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 RBL2Q08999 1139 aa22.31■■□□□ 1.16
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HOXA11-201ENST00000006015 A0A0U1RQJ8 604 aa22.31■■□□□ 1.16
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HOXA11-201ENST00000006015 MFAP3LO75121 409 aa22.31■■□□□ 1.16
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HOXA11-201ENST00000006015 RNF40O75150 1001 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 PRR29P0C7W0 189 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 TRDNQ13061 729 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 FAM107BQ9H098 131 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 FECHP22830 423 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF827Q17R98 1081 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA11-201ENST00000006015 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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