RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VrtnQ3SYK4 740 aa25.83■■□□□ 1.73
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Senp6Q6P7W0 1132 aa25.83■■□□□ 1.73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd3dP04235 173 aa25.82■■□□□ 1.72
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krt84Q99M73 603 aa25.78■■□□□ 1.72
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf287Q9EQB9 759 aa25.77■■□□□ 1.72
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scnn1aQ61180 699 aa25.76■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Otop3Q80UF9 577 aa25.76■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubxn11Q9D572 484 aa25.75■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A0A1W2P7Z8 802 aa25.74■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm9046A0A1W2P855 802 aa25.74■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sv2cQ69ZS6 727 aa25.74■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam155aQ8CCS2 467 aa25.73■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zkscan16A2ALW2 728 aa25.72■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa25.72■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tjap1Q9DCD5 539 aa25.72■■□□□ 1.71
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Med23Q80YQ2 1367 aa25.71■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Has3O08650 554 aa25.71■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MyrflQ3UN70 904 aa25.71■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa25.71■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup133Q8R0G9 1155 aa25.71■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Syt5Q9R0N5 386 aa25.71■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Frmpd4A2AFR3 1320 aa25.7■■□□□ 1.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
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