RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	KIF3A	Q9Y496	699 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	MCM4	P33991	863 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	C12orf60	Q5U649	245 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	TMTC2	Q8N394	836 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	MXD3	Q9BW11	206 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		32.64	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	32.64	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	STX6	O43752	255 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L8	P0C7I0	530 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	LY9	Q9HBG7	655 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC69	A6NI79	296 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	PTMS	P20962	102 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	WTAP	Q15007	396 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	FLT1	P17948	1338 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	SYT1	P21579	422 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	CRK	P46108	304 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	SCNN1D	P51172	638 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	IQCA1	Q86XH1	822 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	GML	Q99445	158 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	CYP2D6	P10635	497 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	GPC2	Q8N158	579 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	APOA5	Q6Q788	366 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	ZBTB43	O43298	467 aa		32.58	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	USP40	Q9NVE5	1235 aa		32.58	■■■□□ 2.81
BRF1-221	ENST00000619151	CPLX1	O14810	134 aa		32.57	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	RCAN1	P53805	252 aa		32.57	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		32.57	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	JAK2	O60674	1132 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	TNKS	O95271	1327 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	SMIM22	K7EJ46	135 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	PRDM1	O75626	825 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	DPF2	Q92785	391 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	MYH1	P12882	1939 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	CDKL5	O76039	1030 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	MMP14	P50281	582 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.54	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	NID2	Q14112	1375 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	TSPY2	A6NKD2	308 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	CTDNEP1	O95476	244 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	TTC6	Q86TZ1	520 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	MTMR6	Q9Y217	621 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	SEC23A	Q15436	765 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	MICU3	Q86XE3	530 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.52	■■■□□ 2.8

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