RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617185.4

TP53-222, Transcript of tumor protein p53, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TP53, Length 2,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53-222	ENST00000617185	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	MTX1	Q13505	466 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TFCP2	Q12800	502 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	KCNB2	Q92953	911 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	STX10	O60499	249 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	MYBL2	P10244	700 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	UBASH3A	P57075	661 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TRAF1	Q13077	416 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CPD	O75976	1380 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	GCK	P35557	465 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	SMTN	P53814	917 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	NCAPH	Q15003	741 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	IKBKB	O14920	756 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185		H3BQV1	296 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	ADAMTS2	O95450	1211 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	SERPINC1	P01008	464 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PSMA5	P28066	241 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CDR1	P51861	262 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	SLC8A3	P57103	927 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53-222	ENST00000617185		A0A0D9SFI3	127 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	MCM3	P25205	808 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	STIM1	Q13586	685 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	UTY	O14607	1347 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185		A6NNZ2	444 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53-222	ENST00000617185	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms