RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.67■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.66■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.66■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 ATP8B2P98198 1209 aa23.65■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 TFCP2Q12800 502 aa23.65■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 USP40Q9NVE5 1235 aa23.65■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 DOCK1Q14185 1865 aa23.64■■□□□ 1.38
SGMS1-208ENST00000608287 ENTPD3O75355 529 aa23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 NFIAQ12857 509 aa23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 POLA2Q14181 598 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 SSH3Q8TE77 659 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 COG6Q9Y2V7 657 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 SYN1P17600 705 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 TIMM10P62072 90 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 A0A1B0GUL7 405 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM75PA6NK02 468 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 ADORA1P30542 326 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 IDI2Q9BXS1 227 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 PHKA1P46020 1223 aa23.6■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.6■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 SLF2Q8IX21 1173 aa23.6■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.6■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K10Q02779 954 aa23.59■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 CEP85Q6P2H3 762 aa23.59■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.59■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 RGS3P49796 1198 aa23.58■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC102BQ68D86 513 aa23.58■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 XAGE2Q96GT9 111 aa23.58■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.58■■□□□ 1.37
SGMS1-208ENST00000608287 SEMA3EO15041 775 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 PRDX5P30044 214 aa23.56■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 PDE3AQ14432 1141 aa23.56■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 GORABQ5T7V8 394 aa23.56■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.56■■□□□ 1.36
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SGMS1-208ENST00000608287 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.55■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.55■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 POTEB2H3BUK9 544 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 GJD2Q9UKL4 321 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D12O60347 775 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 TREML2Q5T2D2 321 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 PFASO15067 1338 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 RASGRF1Q13972 1273 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 GPR108Q9NPR9 543 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 GAKO14976 1311 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-208ENST00000608287 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB22O15209 634 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 COL6A1P12109 1028 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 TNNI3KQ59H18 835 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 TRIB2Q92519 343 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 GUCD1Q96NT3 240 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 CYP2B6P20813 491 aa23.49■■□□□ 1.35
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