RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	SLF2	Q8IX21	1173 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	TEX11	Q8IYF3	940 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	DNAJC18	Q9H819	358 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	GPR108	Q9NPR9	543 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PICK1	Q9NRD5	415 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PLXNB2	O15031	1838 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	CXCL11	O14625	94 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	GABRQ	Q9UN88	632 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	GSTO1	P78417	241 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PRKCZ	Q05513	592 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	SHISA4	Q96DD7	197 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	SRRD	Q9UH36	339 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	FLT1	P17948	1338 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	MYPN	Q86TC9	1320 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	TBC1D12	O60347	775 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PEX10	O60683	326 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	LDHC	P07864	332 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	KIF22	Q14807	665 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	SPP2	Q13103	211 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	PALD1	Q9ULE6	856 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	CAP2	P40123	477 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	EVX2	Q03828	476 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ALPK3	Q96L96	1907 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GDF11	O95390	407 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	CYP7A1	P22680	504 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	HMGCS2	P54868	508 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	PPP4C	P60510	307 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	MYH7	P12883	1935 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	APBB1	O00213	710 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ARHGEF6	Q15052	776 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	AACS	Q86V21	672 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	BCL11A	Q9H165	835 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	COG6	Q9Y2V7	657 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ELN	P15502	786 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	GRK4	P32298	578 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	NBPF11	Q86T75	865 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	RAET1E	Q8TD07	263 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	FCGRT	P55899	365 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	MYH8	P13535	1937 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-231	ENST00000600201	BAG3	O95817	575 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	GNRH1	P01148	92 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	CCL5	P13501	91 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	FLT3LG	P49771	235 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	MTMR2	Q13614	643 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	CEP290	O15078	2479 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	USP17L5	A8MUK1	530 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	CHGB	P05060	677 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	PRMT2	P55345	433 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	ADCY3	O60266	1144 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	INHA	P05111	366 aa		18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	PLCG2	P16885	1265 aa		18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-231	ENST00000600201	HOXD10	P28358	340 aa		18.1	■□□□□ 0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms