RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578995.5

SMARCE1-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, human

TSL 2

Gene SMARCE1, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCE1-215	ENST00000578995	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	STARD3NL	O95772	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	NID1	P14543	1247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SCTR	P47872	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	CD97	P48960	835 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	HLF	Q16534	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	NFIX	Q14938	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MDFI	Q99750	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MYL6B	P14649	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	COPS6	Q7L5N1	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ABCC4	O15439	1325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995		A0A087WZG4	1122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	BCAR3	O75815	825 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	NTSR2	O95665	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	ALB	P02768	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MMP10	P09238	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	RFC4	P35249	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	CASP7	P55210	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	RAC1	P63000	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	FLII	Q13045	1269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SIN3B	O75182	1162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	KCNA3	P22001	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCE1-215	ENST00000578995	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms