RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576106.5

TRAP1-215, Transcript of TNF receptor associated protein 1, human

TSL 4

Gene TRAP1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAP1-215	ENST00000576106	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	FAM196B	A6NMK8	535 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	BTBD19	C9JJ37	291 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	HLA-DOA	P06340	250 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	PALD1	Q9ULE6	856 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	CAP2	P40123	477 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	ERO1A	Q96HE7	468 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	LAMB1	P07942	1786 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	ADD2	P35612	726 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	SP3	Q02447	781 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	TTC6	Q86TZ1	520 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	PDHX	O00330	501 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	TLR2	O60603	784 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	MOGS	Q13724	837 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	UBE3C	Q15386	1083 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	GCC1	Q96CN9	775 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	TRIM75P	A6NK02	468 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	EHD4	Q9H223	541 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	DNAJC18	Q9H819	358 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	GINM1	Q9NU53	330 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	USP17L5	A8MUK1	530 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	ERC2	O15083	957 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	ASNS	P08243	561 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	ARHGEF6	Q15052	776 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	LCORL	Q8N3X6	602 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TRAP1-215	ENST00000576106	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	ARMT1	Q9H993	441 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	TRIM17	Q9Y577	477 aa		27.57	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	MBD4	O95243	580 aa		27.56	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	SPP2	Q13103	211 aa		27.56	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		27.56	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.55	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	EFCC1	Q9HA90	598 aa		27.55	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		27.55	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		27.55	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		27.54	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		27.54	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		27.54	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	MX1	P20591	662 aa		27.53	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	KIF22	Q14807	665 aa		27.53	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		27.53	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.53	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	WDR18	Q9BV38	432 aa		27.53	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.53	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	GDF11	O95390	407 aa		27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	PLCD1	P51178	756 aa		27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	C17orf99	Q6UX52	265 aa		27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		27.52	■■■□□ 2
TRAP1-215	ENST00000576106	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
TRAP1-215	ENST00000576106	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRAP1-215	ENST00000576106	CPA4	Q9UI42	421 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRAP1-215	ENST00000576106	CHGB	P05060	677 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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