RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576069.5

SPNS3-206, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-206ENST00000576069 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 TM4SF4P48230 202 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 FOCADQ5VW36 1801 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 SLURP2P0DP57 97 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 GJA5P36382 358 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 EHD4Q9H223 541 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 MYH7P12883 1935 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 CA12O43570 354 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 PRKAB2O43741 272 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 PPATQ06203 517 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 SREBF2Q12772 1141 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 GNAT2P19087 354 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 RILPL2Q969X0 211 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 FAM196BA6NMK8 535 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 GPAA1O43292 621 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 PPIL2Q13356 520 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 OTUD5Q96G74 571 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 PICK1Q9NRD5 415 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 OTOFQ9HC10 1997 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 M0R2C6 588 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 CAP2P40123 477 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 PLCD1P51178 756 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 GTF2A2P52657 109 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 DNAJC18Q9H819 358 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-206ENST00000576069 PTPRAP18433 802 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 GINM1Q9NU53 330 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 IRF6O14896 467 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 FOXN1O15353 648 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 RNF186Q9NXI6 227 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 GABPAQ06546 454 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SNAPC2Q13487 334 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 TTC22Q5TAA0 569 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 C12orf60Q5U649 245 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L12C9JPN9 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 USP17L21D6R901 530 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 CXCL11O14625 94 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 ALDH1A1P00352 501 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SDSP20132 328 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 CTR9Q6PD62 1173 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 IFNL1Q8IU54 200 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 MYH1P12882 1939 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SIPA1L1O43166 1804 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 HIP1O00291 1037 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 ASNSP08243 561 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 CETPP11597 493 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SBK1Q52WX2 424 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 SWAP70Q9UH65 585 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 TRPA1O75762 1119 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 APPP05067 770 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 CYP2D6P10635 497 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 CCL15Q16663 113 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 FAM227BQ96M60 508 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 PTPN18Q99952 460 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-206ENST00000576069 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SPNS3-206ENST00000576069 SHMT1P34896 483 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS3-206ENST00000576069 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms