RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557030.5

ATXN3-246, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-246ENST00000557030 GFRA2O00451 464 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 LIG3P49916 1009 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 PSMD2Q13200 908 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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ATXN3-246ENST00000557030 CAP2P40123 477 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-246ENST00000557030 CDK8P49336 464 aa7.22□□□□□ -1.25
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ATXN3-246ENST00000557030 CRELD1Q96HD1 420 aa7.21□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 WIZO95785 1651 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 CBLL1Q75N03 491 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 KCT2Q8NC54 265 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 PHC3Q8NDX5 983 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 FBRSQ9HAH7 460 aa7.2□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 RLBP1P12271 317 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 SEPT6Q14141 434 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 MCTP1Q6DN14 999 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 HDXQ7Z353 690 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.19□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 LRIG2O94898 1065 aa7.18□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 NETO1Q8TDF5 533 aa7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 GIPC2Q8TF65 315 aa7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 FBXL18Q96ME1 805 aa7.18□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.17□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 RHOVQ96L33 236 aa7.17□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 SLITRK5O94991 958 aa7.16□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 MRS2Q9HD23 443 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 IRAK1P51617 712 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 LMNB2Q03252 620 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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ATXN3-246ENST00000557030 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 FOXQ1Q9C009 403 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 VAV3Q9UKW4 847 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-246ENST00000557030 CILPO75339 1184 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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ATXN3-246ENST00000557030 GRK4P32298 578 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 SMARCA4P51532 1647 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 HID1Q8IV36 788 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-246ENST00000557030 PICK1Q9NRD5 415 aa7.14□□□□□ -1.27
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