RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 PDHXO00330 501 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 GOLIM4O00461 696 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 TLR2O60603 784 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 EFCC1Q9HA90 598 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 USP5P45974 858 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 PALD1Q9ULE6 856 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.36■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM75PA6NK02 468 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 HLA-DOAP06340 250 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 SOX10P56693 466 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 MOGSQ13724 837 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 SIPA1L1O43166 1804 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 PDE6AP16499 860 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 CAP2P40123 477 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGEF6Q15052 776 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 ATP5JP18859 108 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 KIF22Q14807 665 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 CPA4Q9UI42 421 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD1-208ENST00000555806 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 CAP1Q01518 475 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 PTPRFP10586 1907 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 MYH1P12882 1939 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 RGS19P49795 217 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 C17orf99Q6UX52 265 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 DCTPP1Q9H773 170 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 DNAJC18Q9H819 358 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L5A8MUK1 530 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 CYP2C8P10632 490 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 SPP2Q13103 211 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 HAUS7Q99871 368 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 GDF11O95390 407 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ASNSP08243 561 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 GPATCH3Q96I76 525 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 TTC6Q86TZ1 520 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 CRBNQ96SW2 442 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD1-208ENST00000555806 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 ADD2P35612 726 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 HMGCS2P54868 508 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 LCORLQ8N3X6 602 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 PSMC4P43686 418 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 TREML2Q5T2D2 321 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 EHD4Q9H223 541 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 ARMT1Q9H993 441 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 GINM1Q9NU53 330 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 JAG1P78504 1218 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 MTMR2Q13614 643 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.24■■□□□ 1.15
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