RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553417.1

PRMT5-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-208	ENST00000553417	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	TLE2	Q04725	743 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	TLL1	O43897	1013 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	ITGB8	P26012	769 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	GYG1	P46976	350 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	RIPK4	P57078	832 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	HLA-C	Q95604	372 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	FERMT2	Q96AC1	680 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PRMT5-208	ENST00000553417	UTY	O14607	1347 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	GFRA3	O60609	400 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	SNX17	Q15036	470 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	WDR78	Q5VTH9	848 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	GPR142	Q7Z601	462 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PLXNB2	O15031	1838 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	HMGCS2	P54868	508 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	ATP2B2	Q01814	1243 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	9.07	□□□□□ -0.96	2e-8	■□□□□ 11.2
PRMT5-208	ENST00000553417	GRIK5	Q16478	980 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PHOX2B	Q99453	314 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	RLF	Q13129	1914 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CACNA1G	O43497	2377 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PTPRF	P10586	1907 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	KIAA0355	O15063	1070 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PTPN5	P54829	565 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	MAP2K5	Q13163	448 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	ANO1	Q5XXA6	986 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	GJD3	Q8N144	294 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	DOCK1	Q14185	1865 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PPP2R1A	P30153	589 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	NFIA	Q12857	509 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	SPP2	Q13103	211 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	MORN1	Q5T089	497 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CD320	Q9NPF0	282 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	DOCK2	Q92608	1830 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CHL1	O00533	1208 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	DCX	O43602	365 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	IGKV5-2	P06315	115 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CYP2C19	P33261	490 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	UBE4A	Q14139	1066 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM240	Q5SV17	173 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM199	Q8N511	208 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	USP6NL	Q92738	828 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	MRI	Q9BWK5	157 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PRMT5-208	ENST00000553417	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		9.04	□□□□□ -0.96

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