RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552301.1

PRPF40B-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 912 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-216ENST00000552301 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.26■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 NEFLP07196 543 aa22.25■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 GJA5P36382 358 aa22.25■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 INHBEP58166 350 aa22.25■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 MAP3K10Q02779 954 aa22.25■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.25■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.25■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 APPBP2Q92624 585 aa22.25■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 TTC6Q86TZ1 520 aa22.24■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.24■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.24■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 TSKSQ9UJT2 592 aa22.24■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.23■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 TM4SF4P48230 202 aa22.23■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 PPATQ06203 517 aa22.23■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.23■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 DOCK1Q14185 1865 aa22.22■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.22■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.22■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 ALDH1A1P00352 501 aa22.21■■□□□ 1.15
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PRPF40B-216ENST00000552301 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.21■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.21■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.21■■□□□ 1.15
PRPF40B-216ENST00000552301 SIPA1L1O43166 1804 aa22.2■■□□□ 1.14
PRPF40B-216ENST00000552301 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.2■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 CCL15Q16663 113 aa22.2■■□□□ 1.14
PRPF40B-216ENST00000552301 EHD4Q9H223 541 aa22.2■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 IFNL1Q8IU54 200 aa22.19■■□□□ 1.14
PRPF40B-216ENST00000552301 OSBP2Q969R2 916 aa22.19■■□□□ 1.14
PRPF40B-216ENST00000552301 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.19■■□□□ 1.14
PRPF40B-216ENST00000552301 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.19■■□□□ 1.14
PRPF40B-216ENST00000552301 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.19■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.17■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.16■■□□□ 1.14
PRPF40B-216ENST00000552301 M0R2C6 588 aa22.16■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.16■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 CXCL11O14625 94 aa22.15■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.15■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 GINM1Q9NU53 330 aa22.15■■□□□ 1.14
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PRPF40B-216ENST00000552301 GDF11O95390 407 aa22.14■■□□□ 1.13
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PRPF40B-216ENST00000552301 CYP2D6P10635 497 aa22.14■■□□□ 1.13
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PRPF40B-216ENST00000552301 USP17L5A8MUK1 530 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 USP17L12C9JPN9 530 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 USP17L21D6R901 530 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 PDE4AP27815 886 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 TDO2P48775 406 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 PTPN18Q99952 460 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPF40B-216ENST00000552301 SWAP70Q9UH65 585 aa22.13■■□□□ 1.13
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