RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LNPKQ9C0E8 428 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH1A1P00352 501 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 MCM3P25205 808 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 BIRC3Q13489 604 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 HACL1Q9UJ83 578 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP25P42331 645 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ERMNQ8TAM6 284 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 TCP11Q8WWU5 503 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 PANK2Q9BZ23 570 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 TSPY2A6NKD2 308 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 SMTNL1A8MU46 457 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 NPR1P16066 1061 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 IGBP1P78318 339 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 STK24Q9Y6E0 443 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 TACC1O75410 805 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 PHKG2P15735 406 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 SLFN5Q08AF3 891 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 BICD2Q8TD16 824 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ESR2Q92731 530 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 CHMP2AO43633 222 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 TTLL6Q8N841 843 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ABL2P42684 1182 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 NT5C2P49902 561 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 TUBB4BP68371 445 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 TERF2Q15554 542 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 POTEAQ6S8J7 498 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 NCAPD2Q15021 1401 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 TSPY8P0CW00 308 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 BRD3Q15059 726 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 PTPN14Q15678 1187 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 DKK3Q9UBP4 350 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 KDM1AO60341 852 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 SGSM3Q96HU1 749 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP45Q9UL16 551 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 LRRD1A4D1F6 860 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ZBED4O75132 1171 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 MX1P20591 662 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 BARGINQ6ZT62 677 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 CRB1P82279 1406 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 BMP15O95972 392 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 MXRA7P84157 204 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 DGKZQ13574 1117 aa7.06□□□□□ -1.28
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