RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 TRIB2Q92519 343 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 CYP2B6P20813 491 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 TRIM32Q13049 653 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 CCDC184Q52MB2 194 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 USP44Q9H0E7 712 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 ABCF2Q9UG63 623 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 PTPRFP10586 1907 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 PFASO15067 1338 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 USP17L5A8MUK1 530 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 COL6A1P12109 1028 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 MAPK4P31152 587 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 PHKA1P46020 1223 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 HMGCS2P54868 508 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 MRS2Q9HD23 443 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 POTEB2H3BUK9 544 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 CCDC102BQ68D86 513 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 A0A0C4DFX4 3053 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 LDHCP07864 332 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 CAP2P40123 477 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 GSTO1P78417 241 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 SIL1Q9H173 461 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.77□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.77□□□□□ -0.04
CS-228ENST00000551473 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 RGS2P41220 211 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 GUCD1Q96NT3 240 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 WDR18Q9BV38 432 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 C19orf81C9J6K1 198 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 ASNSP08243 561 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 SLURP2P0DP57 97 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 BACE1P56817 501 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 RHBDL3P58872 404 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 RASGRF1Q13972 1273 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 APBA2Q99767 749 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 GINM1Q9NU53 330 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 FAM196BA6NMK8 535 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 MSCO60682 206 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 HERVK_113P62684 666 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 MECOMQ03112 1051 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 LHX8Q68G74 356 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 ERVK-9P63128 1117 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 ERVK-24P63145 666 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 MTMR2Q13614 643 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 GPR142Q7Z601 462 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 ADORA1P30542 326 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 CCNA1P78396 465 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 USP6NLQ92738 828 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 FAM161BQ96MY7 647 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 COPRSQ9NQ92 184 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 USP17L10C9JJH3 530 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 MORN1Q5T089 497 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-228ENST00000551473 TEX11Q8IYF3 940 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms