RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 HIP1O00291 1037 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 PDE4AP27815 886 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 PALD1Q9ULE6 856 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 GPAA1O43292 621 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 LAMB1P07942 1786 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 INHBEP58166 350 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 VGLL4Q14135 290 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 TTC22Q5TAA0 569 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 LHX8Q68G74 356 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 OSBP2Q969R2 916 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 EHD4Q9H223 541 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 CHGBP05060 677 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 SDSP20132 328 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 SPRYD7Q5W111 196 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 ERO1BQ86YB8 467 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 OPTNQ96CV9 577 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 ELP3Q9H9T3 547 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 PICK1Q9NRD5 415 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-224ENST00000551155 CEP350Q5VT06 3117 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 MYH8P13535 1937 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 DOCK1Q14185 1865 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SIPA1L1O43166 1804 aa11.21□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 AOC2O75106 756 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 APPP05067 770 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 INPP5BP32019 993 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SREBF2Q12772 1141 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 WNK4Q96J92 1243 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 GINM1Q9NU53 330 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 M0R2C6 588 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 PRKAB2O43741 272 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 CAP2P40123 477 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 TDO2P48775 406 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 PPATQ06203 517 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SBK1Q52WX2 424 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SWAP70Q9UH65 585 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 USP17L12C9JPN9 530 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 USP17L21D6R901 530 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 CA12O43570 354 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 ASNSP08243 561 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 TM4SF4P48230 202 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 PLCD1P51178 756 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 GTF2A2P52657 109 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 PPIL2Q13356 520 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 C12orf60Q5U649 245 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 CTR9Q6PD62 1173 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 OTUD5Q96G74 571 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 FAM227BQ96M60 508 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 FAM196BA6NMK8 535 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-224ENST00000551155 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms