RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
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CS-217ENST00000550044 NBPF11Q86T75 865 aa11.91□□□□□ -0.5
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CS-217ENST00000550044 EPAS1Q99814 870 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-217ENST00000550044 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.91□□□□□ -0.5
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CS-217ENST00000550044 ADORA1P30542 326 aa11.88□□□□□ -0.51
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CS-217ENST00000550044 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.88□□□□□ -0.51
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CS-217ENST00000550044 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.87□□□□□ -0.51
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CS-217ENST00000550044 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 PACS2Q86VP3 889 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 XAGE2Q96GT9 111 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.86□□□□□ -0.51
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CS-217ENST00000550044 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 MFSD10Q14728 455 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 GRIK5Q16478 980 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 SHISA4Q96DD7 197 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 BCL11AQ9H165 835 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 IL21Q9HBE4 155 aa11.85□□□□□ -0.51
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CS-217ENST00000550044 APBB1O00213 710 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-217ENST00000550044 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 CCDC102BQ68D86 513 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 OPTNQ96CV9 577 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 PRO3102Q9H379 93 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 ELP3Q9H9T3 547 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-217ENST00000550044 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-217ENST00000550044 UNCXA6NJT0 531 aa11.83□□□□□ -0.52
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CS-217ENST00000550044 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
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CS-217ENST00000550044 VEZTQ9HBM0 779 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-217ENST00000550044 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-217ENST00000550044 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-217ENST00000550044 HMMRO75330 724 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-217ENST00000550044 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
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