RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 FAM227BQ96M60 508 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 EHD4Q9H223 541 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 PICK1Q9NRD5 415 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 LAMA4Q16363 1823 aa21.38■■□□□ 1.01
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BRF1-209ENST00000547052 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.37■■□□□ 1.01
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BRF1-209ENST00000547052 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.37■■□□□ 1.01
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BRF1-209ENST00000547052 GRM1Q13255 1194 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 KLRG1Q96E93 195 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 CDC45O75419 566 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 USP17L12C9JPN9 530 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 USP17L21D6R901 530 aa21.34■■□□□ 1.01
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BRF1-209ENST00000547052 CHMLP26374 656 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 GINM1Q9NU53 330 aa21.34■■□□□ 1.01
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BRF1-209ENST00000547052 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 NOGQ13253 232 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 SBK1Q52WX2 424 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 MOB2Q70IA6 237 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 CAPNS2Q96L46 248 aa21.33■■□□□ 1.01
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BRF1-209ENST00000547052 PDE4BQ07343 736 aa21.32■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 C12orf60Q5U649 245 aa21.32■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.32■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 ASNSP08243 561 aa21.31■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 VGLL4Q14135 290 aa21.31■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 CTR9Q6PD62 1173 aa21.31■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 ERO1BQ86YB8 467 aa21.31■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.31■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.31■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.31■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.31■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 ALX1Q15699 326 aa21.3■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 SLC10A3P09131 477 aa21.29■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 INPP5BP32019 993 aa21.29■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 PLCD1P51178 756 aa21.29■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.29■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.27■■□□□ 1
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BRF1-209ENST00000547052 WNK4Q96J92 1243 aa21.27■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.27■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
BRF1-209ENST00000547052 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.26■□□□□ 0.99
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