RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SLC1A4P43007 532 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA5Q8NB90 893 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TESK2Q96S53 571 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 HS1BP3Q53T59 392 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CROCCP2Q86T23 111 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FAM89AQ96GI7 184 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SSH2Q76I76 1423 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NR1I2O75469 434 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 APBA3O96018 575 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 IVLP07476 585 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 LETM2Q2VYF4 491 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DACT1Q9NYF0 836 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ADCY7P51828 1080 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R7Q15435 360 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CNKSR1Q969H4 720 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 A6NNZ2 444 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NLRX1Q86UT6 975 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SLC27A2O14975 620 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 VAV2P52735 878 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 KIFC2Q96AC6 838 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC169A6NNP5 214 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FBLN1P23142 703 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PSMD1Q99460 953 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SWAP70Q9UH65 585 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PTPRTO14522 1441 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CHL1O00533 1208 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CETN3O15182 167 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 GMNNO75496 209 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TRAF5O00463 557 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PPIP5K2O43314 1243 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SKILP12757 684 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NT5C2P49902 561 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PLCB3Q01970 1234 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 DPH6Q7L8W6 267 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 USP26Q9BXU7 913 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC63Q8NA47 563 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MIS12Q9H081 205 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 UNC13BO14795 1591 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 GLI2P10070 1586 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MYL5Q02045 173 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ASIC2Q16515 512 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 B4E1Z4 1266 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 E7EVH7 732 aa7.14□□□□□ -1.27
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