RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 GYS2P54840 703 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TEKT1Q969V4 418 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RPS6KA1Q15418 735 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC125Q86Z20 511 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM58Q8NG06 486 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RASSF10A6NK89 507 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FLOT1O75955 427 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CLCN6P51797 869 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 APBA1Q02410 837 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 VWA3BQ502W6 1294 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LGSNQ5TDP6 509 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RABGGTAQ92696 567 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC138Q96M89 665 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ZBTB43O43298 467 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 IL1RL1Q01638 556 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ATP2B3Q16720 1220 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LZTS1Q9Y250 596 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TNFAIP3P21580 790 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KCNA4P22459 653 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NBPF4Q96M43 638 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 UIMC1Q96RL1 719 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DESI2Q9BSY9 194 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NUP58Q9BVL2 599 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 IFNAR2P48551 515 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RAP1GDS1P52306 607 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 MAP3K12Q12852 859 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CUX1P39880 1505 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 P3H4Q92791 437 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KAT14Q9H8E8 782 aa9.55□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KRT14P02533 472 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KRT80Q6KB66 452 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DPH6Q7L8W6 267 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NRBF2Q96F24 287 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PPP2R5CQ13362 524 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TADA3O75528 432 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 OCA2Q04671 838 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PLIN2Q99541 437 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RTN1Q16799 776 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SPC25Q9HBM1 224 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM75PA6NK02 468 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CNGA1P29973 690 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KRT2P35908 639 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 BRAPQ7Z569 592 aa9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 MAN1A1P33908 653 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 MSH2P43246 934 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ERMNQ8TAM6 284 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KRT5P13647 590 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SNX1Q13596 522 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 WTAPQ15007 396 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KIFAP3Q92845 792 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TSPY2A6NKD2 308 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TSPY3P0CV98 308 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TSPY8P0CW00 308 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TSPY1Q01534 308 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DPH5Q9H2P9 285 aa9.53□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms