RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 ATP5JP18859 108 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 SIPA1L1O43166 1804 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 FAM196BA6NMK8 535 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 SP3Q02447 781 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 GOLIM4O00461 696 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 TLR2O60603 784 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PDE6AP16499 860 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 USP5P45974 858 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 MOGSQ13724 837 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 HAUS7Q99871 368 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 MYH1P12882 1939 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PTPRFP10586 1907 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 HLA-DOAP06340 250 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 CAP2P40123 477 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PALD1Q9ULE6 856 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM17Q9Y577 477 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 PDHXO00330 501 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 CRBNQ96SW2 442 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 DNAJC18Q9H819 358 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGEF6Q15052 776 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 EFCC1Q9HA90 598 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 MYH7P12883 1935 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM75PA6NK02 468 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 USP17L5A8MUK1 530 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 ADD2P35612 726 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 C17orf99Q6UX52 265 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 GPATCH3Q96I76 525 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 GINM1Q9NU53 330 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 CAP1Q01518 475 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 TTC6Q86TZ1 520 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 EHD4Q9H223 541 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 ASNSP08243 561 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 RGS19P49795 217 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 KIF22Q14807 665 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 SPP2Q13103 211 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 UBE3CQ15386 1083 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 LCORLQ8N3X6 602 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 CPA4Q9UI42 421 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-204ENST00000544999 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 WDR18Q9BV38 432 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 GDF11O95390 407 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 CYP2C8P10632 490 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 AAMPQ13685 434 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD8-204ENST00000544999 MBD4O95243 580 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms