RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 ELP3Q9H9T3 547 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 WBP1LQ9NX94 342 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 TTC6Q86TZ1 520 aa22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 OPTNQ96CV9 577 aa22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 ZIC5Q96T25 663 aa22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.11■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.1■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 GPAA1O43292 621 aa22.1■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 GNAT2P19087 354 aa22.1■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 ERO1BQ86YB8 467 aa22.1■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.1■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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COPS7A-216ENST00000543170 SREBF2Q12772 1141 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 DNAJC18Q9H819 358 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.09■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 M0R2C6 588 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 CA12O43570 354 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 PRKAB2O43741 272 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 PPATQ06203 517 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 TTC22Q5TAA0 569 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 RILPL2Q969X0 211 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.08■■□□□ 1.13
COPS7A-216ENST00000543170 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.08■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 FAM196BA6NMK8 535 aa22.07■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SLURP2P0DP57 97 aa22.07■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 PPIL2Q13356 520 aa22.07■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.07■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 TM4SF4P48230 202 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 INHBEP58166 350 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 GABPAQ06546 454 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 OTUD5Q96G74 571 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 PICK1Q9NRD5 415 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 GINM1Q9NU53 330 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 MYH8P13535 1937 aa22.06■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 HIP1O00291 1037 aa22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 CAP2P40123 477 aa22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 PLCD1P51178 756 aa22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.05■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 PTPRFP10586 1907 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 PTPRAP18433 802 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SDSP20132 328 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 GTF2A2P52657 109 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.04■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 IRF6O14896 467 aa22.03■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SBK1Q52WX2 424 aa22.03■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 C12orf60Q5U649 245 aa22.03■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SWAP70Q9UH65 585 aa22.03■■□□□ 1.12
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COPS7A-216ENST00000543170 A0A0D9SFI3 127 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 USP17L12C9JPN9 530 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 USP17L21D6R901 530 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 ASNSP08243 561 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 SNAPC2Q13487 334 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 CTR9Q6PD62 1173 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 FAM227BQ96M60 508 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.02■■□□□ 1.12
COPS7A-216ENST00000543170 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
COPS7A-216ENST00000543170 CXCL11O14625 94 aa22■■□□□ 1.11
COPS7A-216ENST00000543170 FOXN1O15353 648 aa22■■□□□ 1.11
COPS7A-216ENST00000543170 ALDH1A1P00352 501 aa22■■□□□ 1.11
COPS7A-216ENST00000543170 CYP2D6P10635 497 aa22■■□□□ 1.11
COPS7A-216ENST00000543170 CETPP11597 493 aa22■■□□□ 1.11
COPS7A-216ENST00000543170 SHMT1P34896 483 aa22■■□□□ 1.11
COPS7A-216ENST00000543170 IFNL3Q8IZI9 196 aa22■■□□□ 1.11
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