RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 LEFTY1O75610 366 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 NEFMP07197 916 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 BNIP3Q12983 259 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 CBLL1Q75N03 491 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ISL2Q96A47 359 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 CSADQ9Y600 493 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 FANCCQ00597 558 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 PLCL1Q15111 1095 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 SPRED2Q7Z698 418 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ZNF76P36508 570 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ERVK-24P63145 666 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 RNF214Q8ND24 703 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 NETO1Q8TDF5 533 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 CEP44Q9C0F1 390 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 PICK1Q9NRD5 415 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ENC1O14682 589 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 PAGE1O75459 146 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 PPM1JQ5JR12 505 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 SV2BQ7L1I2 683 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 SAMM50Q9Y512 469 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 U3KQE9 123 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.09□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 RNF34Q969K3 372 aa8.09□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 MISP3Q96FF7 219 aa8.09□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ASIC4Q96FT7 647 aa8.09□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 BMP6P22004 513 aa8.08□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 CD96P40200 585 aa8.08□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 CD8BP10966 210 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 ITGB5P18084 799 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 ITIH2P19823 946 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 C12orf40Q86WS4 652 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.07□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 TRIM37O94972 964 aa8.06□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 CELA3AP09093 270 aa8.06□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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TRDN-204ENST00000542443 VAV3Q9UKW4 847 aa8.06□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 CEACAM5P06731 702 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 PRKCQQ04759 706 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 AOC3Q16853 763 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 GGT7Q9UJ14 662 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 RLBP1P12271 317 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 OGFOD2Q6N063 350 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.04□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 BTBD11A6QL63 1104 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 FUT4P22083 530 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 NTF4P34130 210 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 LIG3P49916 1009 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 COPRSQ9NQ92 184 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDN-204ENST00000542443 BIN1O00499 593 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 FANCGO15287 622 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PAPLNO95428 1278 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
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