RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 CNTNAP1P78357 1384 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 UTRNP46939 3433 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 ORC4O43929 436 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 ST18O60284 1047 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 FGRP09769 529 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 PLCD1P51178 756 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 RUFY3Q7L099 469 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 ESR2Q92731 530 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.16□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 NEDD4P46934 1319 aa14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 RPS6KB1P23443 525 aa14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 MCM5P33992 734 aa14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 RASA3Q14644 834 aa14.15□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.15□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 HOOK2Q96ED9 719 aa14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 CSRNP1Q96S65 589 aa14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.15□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.15□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 SIPA1L1O43166 1804 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 B4E1Z4 1266 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 CDK8P49336 464 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 NEK4P51957 841 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 GABPAQ06546 454 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.14□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 MYH8P13535 1937 aa14.13□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 EVX2Q03828 476 aa14.13□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.13□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 SMIM22K7EJ46 135 aa14.12□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.12□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.12□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 ERICH2A1L162 156 aa14.11□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 PRC1O43663 620 aa14.11□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TBC1D12O60347 775 aa14.11□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 PRDM1O75626 825 aa14.11□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 RASA1P20936 1047 aa14.11□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 HSCBQ8IWL3 235 aa14.11□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 CCDC17Q96LX7 622 aa14.11□□□□□ -0.15
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LMO3-218ENST00000538020 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TSPY3P0CV98 308 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TSPY8P0CW00 308 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 SHMT1P34896 483 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 ANTXR2P58335 489 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 BECN1Q14457 450 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 DCAF15Q66K64 600 aa14.1□□□□□ -0.15
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