RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 HOOK2Q96ED9 719 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SLC27A2O14975 620 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 TOMM70O94826 608 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 CDCA5Q96FF9 252 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 DNAJC18Q9H819 358 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 RASEFQ8IZ41 740 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SWAP70Q9UH65 585 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 PASKQ96RG2 1323 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 TRAF5O00463 557 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ORC4O43929 436 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SLURP2P0DP57 97 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SHMT1P34896 483 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 CDK8P49336 464 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 NT5C2P49902 561 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 HAND2P61296 217 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 RNF20Q5VTR2 975 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ANAPC15P60006 121 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 PDE4BQ07343 736 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 FSTL1Q12841 308 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 MAP3K11Q16584 847 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 DCAF15Q66K64 600 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 INCENPQ9NQS7 918 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 FOCADQ5VW36 1801 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 E7EWF7 191 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 RASA1P20936 1047 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 KLRG1Q96E93 195 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-217ENST00000537757 UNCXA6NJT0 531 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 MCCP23508 829 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NF2P35240 595 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 FKBP1BP68106 108 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 KRT32Q14532 448 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CST9Q5W186 159 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CCDC17Q96LX7 622 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 FAM196BA6NMK8 535 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 KRT23Q9C075 422 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 GINM1Q9NU53 330 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NEDD4P46934 1319 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 PRDM1O75626 825 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CAP2P40123 477 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NOVP48745 357 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 JAG1P78504 1218 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 MAP3K9P80192 1104 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 KIF2CQ99661 725 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms