RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 PALD1Q9ULE6 856 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 PPATQ06203 517 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 TTC6Q86TZ1 520 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 PICK1Q9NRD5 415 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 RNF186Q9NXI6 227 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 FAM196BA6NMK8 535 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 TRPA1O75762 1119 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 CHGBP05060 677 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 SLURP2P0DP57 97 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 GTF2A2P52657 109 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 PPIL2Q13356 520 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 APPBP2Q92624 585 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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PTPRK-222ENST00000532751 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 EVI5LQ96CN4 794 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 ALDH1A1P00352 501 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 TSKSQ9UJT2 592 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 IRF6O14896 467 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 SNAPC2Q13487 334 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 IFNL1Q8IU54 200 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 EHD4Q9H223 541 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 CETPP11597 493 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 PTPRAP18433 802 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 CAP2P40123 477 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 CCL15Q16663 113 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 OSBP2Q969R2 916 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-222ENST00000532751 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.38■■□□□ 1.81
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PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC18Q9H819 358 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 MYH8P13535 1937 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
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PTPRK-222ENST00000532751 NEFLP07196 543 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 GNAT2P19087 354 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 TICAM2Q86XR7 235 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 GINM1Q9NU53 330 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 CXCL11O14625 94 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 PLCD1P51178 756 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 RILPL2Q969X0 211 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 M0R2C6 588 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 ASNSP08243 561 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 PTPN18Q99952 460 aa26.34■■□□□ 1.81
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PTPRK-222ENST00000532751 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 PTPRFP10586 1907 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D8O95759 1140 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-222ENST00000532751 USP17L5A8MUK1 530 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 GDF11O95390 407 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 USP17L12C9JPN9 530 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 USP17L21D6R901 530 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 PDE4AP27815 886 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
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