RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 BTDP43251 543 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIM32Q13049 653 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 SPP2Q13103 211 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 PICALMQ13492 652 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 SIL1Q9H173 461 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 PLXNB2O15031 1838 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 CCDC102BQ68D86 513 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIB2Q92519 343 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 ABCF2Q9UG63 623 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 HMGCS2P54868 508 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 RHBDL3P58872 404 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 RASGRF1Q13972 1273 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 PFASO15067 1338 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM196BA6NMK8 535 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L5A8MUK1 530 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 COL6A1P12109 1028 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 ADORA1P30542 326 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 CAP2P40123 477 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-206ENST00000530405 CYP2B6P20813 491 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 MECOMQ03112 1051 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF521Q96K83 1311 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 TIMM10P62072 90 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF384Q8TF68 577 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR18Q9BV38 432 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 COPRSQ9NQ92 184 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 POTEB2H3BUK9 544 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 LDHCP07864 332 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 GSTO1P78417 241 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 LHX8Q68G74 356 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 USP6NLQ92738 828 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 MAPK4P31152 587 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 BACE1P56817 501 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 HERVK_113P62684 666 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 MTMR2Q13614 643 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 PDE3AQ14432 1141 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-206ENST00000530405 A0A1B0GUL7 405 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 XAGE2Q96GT9 111 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 GUCD1Q96NT3 240 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 C19orf81C9J6K1 198 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 ASNSP08243 561 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 RGS2P41220 211 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 VCANP13611 3396 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 ANP32CO43423 234 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 PEX10O60683 326 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 MORN1Q5T089 497 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.18■□□□□ 0.82
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