RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 HAUS7Q99871 368 aa22.37■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.37■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.37■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 HLA-DOAP06340 250 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 PDE6AP16499 860 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 CAP2P40123 477 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 MOGSQ13724 837 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 GINM1Q9NU53 330 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 FOCADQ5VW36 1801 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 DOCK1Q14185 1865 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 USP5P45974 858 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 AAMPQ13685 434 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.34■■□□□ 1.17
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TSPAN4-216ENST00000526055 SLURP2P0DP57 97 aa22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 GPATCH3Q96I76 525 aa22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 PALD1Q9ULE6 856 aa22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM196BA6NMK8 535 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 BCL11AQ9H165 835 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM17Q9Y577 477 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 ASNSP08243 561 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 TTC6Q86TZ1 520 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 EHD4Q9H223 541 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 EFCC1Q9HA90 598 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 USP17L5A8MUK1 530 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 ADD2P35612 726 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 DNAJC18Q9H819 358 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 RGS19P49795 217 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF22Q14807 665 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 UBE3CQ15386 1083 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 C17orf99Q6UX52 265 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 CRBNQ96SW2 442 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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TSPAN4-216ENST00000526055 GNRH1P01148 92 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 WDR18Q9BV38 432 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 SIPA1L1O43166 1804 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 SPP2Q13103 211 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPAN4-216ENST00000526055 PTPRFP10586 1907 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 MYH1P12882 1939 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 GCC1Q96CN9 775 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 PNMA3Q9UL41 463 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 ERC2O15083 957 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 PRMT2P55345 433 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 LCORLQ8N3X6 602 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 CPA4Q9UI42 421 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 C19orf81C9J6K1 198 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 BCRP11274 1271 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-216ENST00000526055 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.24■■□□□ 1.15
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