RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522574.5

TNIP1-215, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, human

TSL 2

Gene TNIP1, Length 1,394 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNIP1-215	ENST00000522574	CYP21A2	P08686	494 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	FGR	P09769	529 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	CYP2D6	P10635	497 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	NT5C2	P49902	561 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	GABPA	Q06546	454 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	ANAPC15	P60006	121 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	HTRA3	P83110	453 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	PDE4B	Q07343	736 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	CDK8	P49336	464 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	HAND2	P61296	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	KRT32	Q14532	448 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNIP1-215	ENST00000522574	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574		E7EWF7	191 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ORC4	O43929	436 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	KRT23	Q9C075	422 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	PSMA5	P28066	241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	NF2	P35240	595 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	EVX2	Q03828	476 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TRDN	Q13061	729 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	SHMT1	P34896	483 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ESR2	Q92731	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	GINM1	Q9NU53	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	RASA1	P20936	1047 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNIP1-215	ENST00000522574	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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