RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520903.1

RNF19A-208, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RNF19A, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-208	ENST00000520903	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MAPK8	P45983	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	TNP2	Q05952	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ACD	Q96AP0	544 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MSTN	O14793	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	BNIP3L	O60238	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	BTAF1	O14981	1849 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	XYLB	O75191	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PCSK2	P16519	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	DAB2	P98082	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PIGB	Q92521	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ADAM23	O75077	832 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	IL13	P35225	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MAP2K3	P46734	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	EREG	O14944	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	OIP5	O43482	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PHKG2	P15735	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	EPB42	P16452	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	LY75	O60449	1722 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms