RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLFN14P0C7P3 912 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GDNFP39905 211 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AFMP43652 599 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLCN7P51798 805 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVK-24P63145 666 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM67Q5HYA8 995 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPZL3Q6UWV2 235 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SULF2Q8IWU5 870 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNB2Q92953 911 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC74AQ96AQ1 378 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPA12BQ96MM6 686 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM129BQ96TA1 746 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST14Q9Y5Y6 855 aa2.51□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WASH4PA8MWX3 477 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCDC2CA8MYV0 355 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFIBO00712 420 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAGE1O75459 146 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABL1P00519 1130 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERPINB4P48594 390 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00310P59036 64 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RALGPS1Q5JS13 557 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARMCX6Q7L4S7 300 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIN3Q8TB24 985 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC25Q9H1X3 360 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBRSQ9HAH7 460 aa2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BS24 57 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ICMTO60725 284 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ESR1P03372 595 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLDCP23378 1020 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARNTP27540 789 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCGRTP55899 365 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGD1P98174 961 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFKB2Q00653 900 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB37Q5TC79 503 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDKAL1Q5VV42 579 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C12orf40Q86WS4 652 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPB41L4BQ9H329 900 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM39AQ9NV64 488 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa2.49□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BRB1 525 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENC1O14682 589 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUAK1O60285 661 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM13O60858 407 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFEMP2O95967 443 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BMP6P22004 513 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK8P49336 464 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKG7Q16617 165 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIGD5Q53EQ6 642 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CIAPIN1Q6FI81 312 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C22orf34Q6ZV56 151 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GGNQ86UU5 652 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3orf58Q8NDZ4 430 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNC2Q96PR1 638 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALPK1Q96QP1 1244 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXQ1Q9C009 403 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NIF3L1Q9GZT8 377 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF32Q9H0A6 362 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCM1Q9NP62 436 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARD6AQ9NPB6 346 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLAMF8Q9P0V8 285 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa2.48□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCAF2A6NFQ2 919 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARID3CA6NKF2 412 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNAT3A8MTJ3 354 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPXP02790 462 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM253P0C7T8 217 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NME2P22392 152 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INPP5AQ14642 412 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSPNQ14714 243 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRFN4Q6PJG9 635 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DTHD1Q6ZMT9 781 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFSD4AQ8N468 514 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABHD4Q8TB40 342 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RELTQ969Z4 430 aa2.47□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCOLN1Q9GZU1 580 aa2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms