RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 HHIPQ96QV1 700 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 SBNO1A3KN83 1393 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 FAM177BA6PVY3 158 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 CDC27P30260 824 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 SETDB2Q96T68 719 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 TCF12Q99081 682 aa9.9□□□□□ -0.82
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PDE4D-222ENST00000514552 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.9□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGEF10O15013 1369 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 FRMD6Q96NE9 622 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 GIPC1O14908 333 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 GRM2Q14416 872 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 PI16Q6UXB8 463 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.87□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.87□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 SOX13Q9UN79 622 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 PPME1Q9Y570 386 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.87□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 RAC1P63000 192 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 A0A096LPE4 126 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PPZ6 126 aa9.85□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 A0A0A0MRY4 1105 aa9.84□□□□□ -0.83
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PDE4D-222ENST00000514552 H3BRJ5 948 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 EPHA1P21709 976 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 ITPKAP23677 461 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 ITSN1Q15811 1721 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-222ENST00000514552 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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PDE4D-222ENST00000514552 VPS72Q15906 364 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.83□□□□□ -0.84
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PDE4D-222ENST00000514552 PARP2Q9UGN5 583 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 NRAPQ86VF7 1730 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 LINC01387J3KSC0 135 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 FBXO11Q86XK2 927 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 GIPC2Q8TF65 315 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 C12orf49Q9H741 205 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 POGKQ9P215 609 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.82□□□□□ -0.84
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