RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 IGSF3O75054 1194 aa30.19■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 SIPA1L1O43166 1804 aa30.19■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 CTGFP29279 349 aa30.18■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM47Q96LD4 638 aa30.18■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa30.18■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 MGAMO43451 1857 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 BCRP11274 1271 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 HOXD10P28358 340 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRA1Q86SQ6 560 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 ERC1Q8IUD2 1116 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 SH3TC2Q8TF17 1288 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 LOC285556D6RIA3 1793 aa30.17■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 MS4A1P11836 297 aa30.16■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 EN2P19622 333 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
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ALYREF-203ENST00000511412 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 OSBPP22059 807 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 PPP4CP60510 307 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 FLT1P17948 1338 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 CAP2P40123 477 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 FCGRTP55899 365 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 TBC1D2Q9BYX2 928 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 MYPNQ86TC9 1320 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-203ENST00000511412 SLC34A2O95436 690 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 MYCP01106 439 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 RAET1EQ8TD07 263 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 AACSQ86V21 672 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 IDH1O75874 414 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 CYP7A1P22680 504 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF280CQ8ND82 737 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 PNMA3Q9UL41 463 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 SPP2Q13103 211 aa30.1■■■□□ 2.41
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ALYREF-203ENST00000511412 TREML2Q5T2D2 321 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM34Q9BYJ4 488 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 AS3MTQ9HBK9 375 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-203ENST00000511412 GRK4P32298 578 aa30.08■■■□□ 2.41
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ALYREF-203ENST00000511412 HMGCS2P54868 508 aa30.07■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 CERS3Q8IU89 383 aa30.07■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEB6Q8N7X4 407 aa30.07■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 RHPN1Q8TCX5 695 aa30.07■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC18Q9H819 358 aa30.07■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa30.07■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 PALD1Q9ULE6 856 aa30.07■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K12Q12852 859 aa30.06■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 COG6Q9Y2V7 657 aa30.06■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 MYH1P12882 1939 aa30.06■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 HMMRO75330 724 aa30.05■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 ASNSP08243 561 aa30.05■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
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ALYREF-203ENST00000511412 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 MIGA1Q8NAN2 632 aa30.05■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.05■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa30.04■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 USP5P45974 858 aa30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 MTFR1Q15390 333 aa30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 FAM110CQ1W6H9 321 aa30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 SH3D19Q5HYK7 790 aa30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 SLAIN1Q8ND83 568 aa30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 KIF1BPQ96EK5 621 aa30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 GABRQQ9UN88 632 aa30.03■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 MTMR2Q13614 643 aa30.02■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 WDR18Q9BV38 432 aa30.02■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.02■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.02■■■□□ 2.4
ALYREF-203ENST00000511412 APBB1O00213 710 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-203ENST00000511412 GDF11O95390 407 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-203ENST00000511412 UBXN2AP68543 259 aa30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-203ENST00000511412 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-203ENST00000511412 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ALYREF-203ENST00000511412 GINM1Q9NU53 330 aa30.01■■■□□ 2.39
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