RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA3-210ENST00000507771 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.18□□□□□ -0.3
ITGA3-210ENST00000507771 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
ITGA3-210ENST00000507771 HHIPL1Q96JK4 782 aa13.18□□□□□ -0.3
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ITGA3-210ENST00000507771 KRT23Q9C075 422 aa13.18□□□□□ -0.3
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