RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 NTF4P34130 210 aa7.68□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 PRKCQQ04759 706 aa7.68□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 COL19A1Q14993 1142 aa7.68□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.68□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 HDXQ7Z353 690 aa7.68□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 SPRED2Q7Z698 418 aa7.68□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.68□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.68□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 CD8BP10966 210 aa7.66□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.66□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 ASIC4Q96FT7 647 aa7.66□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.66□□□□□ -1.18
UBE2B-202ENST00000499038 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.65□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
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UBE2B-202ENST00000499038 FUT4P22083 530 aa7.64□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 MAP3K11Q16584 847 aa7.64□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.64□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.64□□□□□ -1.19
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UBE2B-202ENST00000499038 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.63□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.63□□□□□ -1.19
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UBE2B-202ENST00000499038 RNF19AQ9NV58 838 aa7.63□□□□□ -1.19
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UBE2B-202ENST00000499038 EOMESO95936 686 aa7.61□□□□□ -1.19
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UBE2B-202ENST00000499038 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.61□□□□□ -1.19
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UBE2B-202ENST00000499038 ASB11Q8WXH4 323 aa7.61□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 MIPEPQ99797 713 aa7.61□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.61□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.61□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 PARP2Q9UGN5 583 aa7.61□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.61□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.61□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 GRK4P32298 578 aa7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 CDK8P49336 464 aa7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 HID1Q8IV36 788 aa7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.6□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 SLITRK5O94991 958 aa7.59□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 PAPLNO95428 1278 aa7.59□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.193e-17■■■□□ 15.4
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UBE2B-202ENST00000499038 NKG7Q16617 165 aa7.59□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.59□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.59□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.59□□□□□ -1.19
UBE2B-202ENST00000499038 RLBP1P12271 317 aa7.58□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 DAB2P98082 770 aa7.58□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.58□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.58□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.58□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.58□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 CAP2P40123 477 aa7.57□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 ZP2Q05996 745 aa7.57□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.57□□□□□ -1.2
UBE2B-202ENST00000499038 OGFOD2Q6N063 350 aa7.57□□□□□ -1.2
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