RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 GFRA2O00451 464 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 SELPP16109 830 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 PDE4BQ07343 736 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 MLECQ14165 292 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 PPM1JQ5JR12 505 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 FDX2Q6P4F2 183 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 DYMQ7RTS9 669 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ARMC5Q96C12 935 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 C9orf172C9J069 976 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 DYRK3O43781 588 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ALX3O95076 343 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 DRD2P14416 443 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 GRK4P32298 578 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 PPP2R5EQ16537 467 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 SOGA3Q5TF21 947 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 DPH6Q7L8W6 267 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 MEGF11A6BM72 1044 aa6.54□□□□□ -1.36
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POLR1B-215ENST00000498054 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 HTR3BO95264 441 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 PGRP06401 933 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 IMPDH2P12268 514 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ADGRE1Q14246 886 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 MBTPS1Q14703 1052 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 SHDQ96IW2 340 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 LNPKQ9C0E8 428 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 PIDD1Q9HB75 910 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL3Q9UH77 587 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 TMPRSS2O15393 492 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ADH5P11766 374 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 GLB1P16278 677 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ASPAP45381 313 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ERVK-24P63145 666 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 RBL2Q08999 1139 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-215ENST00000498054 F8W735 103 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 ATE1O95260 518 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 GIPRP48546 466 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 USP11P51784 963 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 TTLL4Q14679 1199 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 DISC1Q9NRI5 854 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 NACADO15069 1562 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 FANCGO15287 622 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 TNNI3KQ59H18 835 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 RNF214Q8ND24 703 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1B-215ENST00000498054 RAB6AP20340 208 aa6.5□□□□□ -1.37
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