RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM75PA6NK02 468 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 DOCK1Q14185 1865 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 CPA4Q9UI42 421 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 PALD1Q9ULE6 856 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 CENPFP49454 3210 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 CAP2P40123 477 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 C17orf99Q6UX52 265 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 GOLIM4O00461 696 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 DNAJC18Q9H819 358 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 SIPA1L1O43166 1804 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 CYP2C8P10632 490 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 USP5P45974 858 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGEF6Q15052 776 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 CERS3Q8IU89 383 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-207ENST00000492954 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PDE6AP16499 860 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 KIF22Q14807 665 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 FOCADQ5VW36 1801 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 HLA-DOAP06340 250 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ATP5JP18859 108 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 SPP2Q13103 211 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 USP17L5A8MUK1 530 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 CTGFP29279 349 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 JAG1P78504 1218 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 TREML2Q5T2D2 321 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PTPRFP10586 1907 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 GDF11O95390 407 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 BCRP11274 1271 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PSMC4P43686 418 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 HMGCS2P54868 508 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ARMC5Q96C12 935 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM47Q96LD4 638 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 HAUS7Q99871 368 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ASNSP08243 561 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 DCTPP1Q9H773 170 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 GNRH1P01148 92 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 WDR18Q9BV38 432 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-207ENST00000492954 BRCA2P51587 3418 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 LCORLQ8N3X6 602 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 EHD4Q9H223 541 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 POTEFA5A3E0 1075 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 CHGBP05060 677 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-207ENST00000492954 ADD2P35612 726 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms