RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 RTN1Q16799 776 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 ALG1Q9BT22 464 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 BAG3O95817 575 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 ALDH1B1P30837 517 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 NBPF11Q86T75 865 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 PHKBQ93100 1093 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 GAKO14976 1311 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 CYP2D6P10635 497 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 EVX2Q03828 476 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 C12orf60Q5U649 245 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 FANCBQ8NB91 859 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 AIFM3Q96NN9 605 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 C6orf229H3BNL8 230 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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NELFE-211ENST00000492185 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 COA1Q9GZY4 146 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 KIF28PB7ZC32 967 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 KRT40Q6A162 431 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 POTEAQ6S8J7 498 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 IQCA1Q86XH1 822 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 WASF1Q92558 559 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 PRDM1O75626 825 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 USP17L8P0C7I0 530 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 PDE4BQ07343 736 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 YEATS4O95619 227 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.32e-6■■■□□ 16.4
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NELFE-211ENST00000492185 MPNDQ8N594 471 aa23.2■■□□□ 1.3
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NELFE-211ENST00000492185 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.2■■□□□ 1.3
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NELFE-211ENST00000492185 DDAH1O94760 285 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 USP5P45974 858 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 TROAPQ12815 778 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 SLF2Q8IX21 1173 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 MYH1P12882 1939 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 CALM1P0DP23 149 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 CALM2P0DP24 149 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 CALM3P0DP25 149 aa23.19■■□□□ 1.3
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NELFE-211ENST00000492185 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 STYK1Q6J9G0 422 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 DACT1Q9NYF0 836 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 DEXIO95424 95 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 BTDP43251 543 aa23.18■■□□□ 1.3
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NELFE-211ENST00000492185 SLC15A2Q16348 729 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.18■■□□□ 1.3
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NELFE-211ENST00000492185 ANKS1AQ92625 1134 aa23.18■■□□□ 1.3
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NELFE-211ENST00000492185 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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NELFE-211ENST00000492185 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 MSL1Q68DK7 614 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 NR1I2O75469 434 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 GUCY1A2P33402 732 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 BICD2Q8TD16 824 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 A0A1W2PQ27 194 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 A0A1W2PQ64 194 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 A0A1W2PQD8 194 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K11Q16584 847 aa23.16■■□□□ 1.3
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