RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	PPM1J	Q5JR12	505 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ENC1	O14682	589 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	FANCG	O15287	622 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM37	O94972	964 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	KCNMB1	Q16558	191 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	TMC7	Q7Z402	723 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	IKZF1	Q13422	519 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	MLANA	Q16655	118 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	RASIP1	Q5U651	963 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PAGE1	O75459	146 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	SLITRK5	O94991	958 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	GLI1	P08151	1106 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CAP2	P40123	477 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	AFM	P43652	599 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	TREH	O43280	583 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	LRIG2	O94898	1065 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	RAP1GAP	P47736	663 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	C12orf40	Q86WS4	652 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	GDNF	P39905	211 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	KCT2	Q8NC54	265 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CSAD	Q9Y600	493 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	PRR33	A8MZF0	331 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	TMC1	Q8TDI8	760 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	TOX2	Q96NM4	488 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	FOXQ1	Q9C009	403 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	INPP5A	Q14642	412 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	KIRREL1	Q96J84	757 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CEP44	Q9C0F1	390 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	GSTT1	P30711	240 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	FBF1	Q8TES7	1133 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	FBRS	Q9HAH7	460 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
TTC3-222	ENST00000491952	C1QTNF9	P0C862	333 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	MED14OS	P0DP75	135 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	PLCB3	Q01970	1234 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC14	Q15048	493 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	CBX8	Q9HC52	389 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	SAMM50	Q9Y512	469 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	NKG7	Q16617	165 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTC3-222	ENST00000491952	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		6.06	□□□□□ -1.44

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