RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
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PTPRC-212ENST00000491302 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.4□□□□□ -0.58
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PTPRC-212ENST00000491302 RNF208Q9H0X6 261 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRC-212ENST00000491302 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.4□□□□□ -0.58
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PTPRC-212ENST00000491302 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.34□□□□□ -0.59
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PTPRC-212ENST00000491302 PDPK1O15530 556 aa11.32□□□□□ -0.6
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PTPRC-212ENST00000491302 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 FAM13CQ8NE31 585 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 DISC1Q9NRI5 854 aa11.32□□□□□ -0.6
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PTPRC-212ENST00000491302 RAG1P15918 1043 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 CCNFP41002 786 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 FDX2Q6P4F2 183 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 PODNQ7Z5L7 613 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRC-212ENST00000491302 PIDD1Q9HB75 910 aa11.31□□□□□ -0.6
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