RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNA6	P17658	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP1A2	P50993	1020 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MLKL	Q8NB16	471 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ZPR1	O75312	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ERLIN2	O94905	339 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GRIN1	Q05586	938 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	RTN1	Q16799	776 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	NEO1	Q92859	1461 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	KCTD16	Q68DU8	428 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	EYA2	O00167	538 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	A1BG	P04217	495 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ODF2	Q5BJF6	829 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	USP49	Q70CQ1	688 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	IFT81	Q8WYA0	676 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	WASF1	Q92558	559 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM170A	A1A519	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	IDE	P14735	1019 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	PRDM1	O75626	825 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CDR1	P51861	262 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GNGT1	P63211	74 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	WTAP	Q15007	396 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TULP2	O00295	520 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GC	P02774	474 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	INPP5B	P32019	993 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEA9	P43362	315 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	USP8	P40818	1118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	SPA17	Q15506	151 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	COL15A1	P39059	1388 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63

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