RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483521.1

PKN3-202, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

TSL 5

Gene PKN3, Length 597 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-202ENST00000483521 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.13■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 HAUS7Q99871 368 aa22.13■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 GOLIM4O00461 696 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 PPATQ06203 517 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 PPIL2Q13356 520 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 TBC1D12O60347 775 aa22.11■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 SNAPC2Q13487 334 aa22.11■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.11■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 CETPP11597 493 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 CCL15Q16663 113 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 41.1
PKN3-202ENST00000483521 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 PICK1Q9NRD5 415 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 FLT1P17948 1338 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 TBC1D8O95759 1140 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 PDE6AP16499 860 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 CHMLP26374 656 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 RAD50Q92878 1312 aa22.08■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 IRF6O14896 467 aa22.08■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.08■■□□□ 1.13
PKN3-202ENST00000483521 HLA-DOAP06340 250 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 USP5P45974 858 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 FOCADQ5VW36 1801 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 GPR25O00155 361 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 IL27Q8NEV9 243 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 PTPN18Q99952 460 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 FSD1Q9BTV5 496 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 SEC24BO95487 1268 aa22.04■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 DOCK1Q14185 1865 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 CXCL11O14625 94 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 FKTNO75072 461 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 PTPRAP18433 802 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 CRHR2Q13324 411 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 DGKZQ13574 1117 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 PALD1Q9ULE6 856 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 MCCP23508 829 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ADD2P35612 726 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PKN3-202ENST00000483521 FAM196BA6NMK8 535 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 CAP2P40123 477 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 UBE3CQ15386 1083 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 TTC6Q86TZ1 520 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 BTBD19C9JJ37 291 aa22■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 SGSM2O43147 1006 aa22■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 SLURP2P0DP57 97 aa22■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PKN3-202ENST00000483521 ANKRD23Q86SG2 305 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms