RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 CEP250Q9BV73 2442 aa5.31□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PLXNA3P51805 1871 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 SPEGQ15772 3267 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 LGR5O75473 907 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 KCNQ1P51787 676 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 GRIN2CQ14957 1233 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 DAPK1P53355 1430 aa5.3□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 SOBPA7XYQ1 873 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 TFF2Q03403 129 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 KCNC4Q03721 635 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 AGERQ15109 404 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PRSS33Q8NF86 280 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 MRS2Q9HD23 443 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 COL4A6Q14031 1691 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 ADM5C9JUS6 153 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 ZZEF1O43149 2961 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 RPS6KA4O75676 772 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 GJB1P08034 283 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PLCB3Q01970 1234 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 DSC3Q14574 896 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 LINC01559Q495D7 138 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 OLFM4Q6UX06 510 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 TMC4Q7Z404 712 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
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SHQ1-208ENST00000482785 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF358Q9NW07 568 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-208ENST00000482785 BACH1O14867 736 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SORBS3O60504 671 aa5.27□□□□□ -1.57
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SHQ1-208ENST00000482785 MPSTP25325 297 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SOGA3Q5TF21 947 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 C16orf46Q6P387 395 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF511Q8NB15 262 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PIGBQ92521 554 aa5.27□□□□□ -1.57
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SHQ1-208ENST00000482785 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CD320Q9NPF0 282 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PARP2Q9UGN5 583 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 VPS8Q8N3P4 1428 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 DAB2P98082 770 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ATP2B2Q01814 1243 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 EHHADHQ08426 723 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 NFIXQ14938 502 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC93Q567U6 631 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 MOB2Q70IA6 237 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 DPH6Q7L8W6 267 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 JDP2Q8WYK2 163 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 BAP1Q92560 729 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 FOXJ1Q92949 421 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 RNF34Q969K3 372 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
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