RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473511.5

MIB2-208, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 1,332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-208	ENST00000473511	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	SP3	Q02447	781 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	CXCL11	O14625	94 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	USP5	P45974	858 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	ERO1A	Q96HE7	468 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	SIPA1L1	O43166	1804 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	MOGS	Q13724	837 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	HAUS7	Q99871	368 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	TRIM17	Q9Y577	477 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		27.64	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	TRIM75P	A6NK02	468 aa		27.64	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	PDHX	O00330	501 aa		27.64	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		27.64	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	TLR2	O60603	784 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	HLA-DOA	P06340	250 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	CAP2	P40123	477 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	DNAJC18	Q9H819	358 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	CAP1	Q01518	475 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	EFCC1	Q9HA90	598 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	GPATCH3	Q96I76	525 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01	9e-10	■■■■□ 20.3
MIB2-208	ENST00000473511	MYH1	P12882	1939 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	GDF11	O95390	407 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	ADD2	P35612	726 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	LCORL	Q8N3X6	602 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	CPA4	Q9UI42	421 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-208	ENST00000473511	CHGB	P05060	677 aa		27.57	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	CYP2C8	P10632	490 aa		27.57	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	SPP2	Q13103	211 aa		27.57	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	PTPRF	P10586	1907 aa		27.57	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	USP17L5	A8MUK1	530 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	JAG1	P78504	1218 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ARMT1	Q9H993	441 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	SOX10	P56693	466 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	C17orf99	Q6UX52	265 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	TTC6	Q86TZ1	520 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	MBD4	O95243	580 aa		27.54	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ASNS	P08243	561 aa		27.54	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		27.54	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		27.54	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		27.54	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	HMGCS2	P54868	508 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	KIF22	Q14807	665 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	EHD4	Q9H223	541 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	PLCD1	P51178	756 aa		27.52	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ARHGEF6	Q15052	776 aa		27.52	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	TREML2	Q5T2D2	321 aa		27.52	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		27.52	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		27.52	■■■□□ 2
MIB2-208	ENST00000473511	UBE3C	Q15386	1083 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MIB2-208	ENST00000473511	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MIB2-208	ENST00000473511	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
MIB2-208	ENST00000473511	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		27.51	■■□□□ 1.99

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