RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471676.1

HUWE1-208, Transcript of HECT, UBA and WWE domain containing 1, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene HUWE1, Length 501 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HUWE1-208	ENST00000471676	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	RAB6A	P20340	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	GRK4	P32298	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	ISL2	Q96A47	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HUWE1-208	ENST00000471676	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ATE1	O95260	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	HTR3B	O95264	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PROC	P04070	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	FGR	P09769	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	BMP3	P12645	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	USP11	P51784	963 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	CLC	Q05315	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	GML	Q99445	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PGR	P06401	933 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	NFIC	P08651	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	MCM4	P33991	863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ZNF165	P49910	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ARID5A	Q03989	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PDE4B	Q07343	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	DNAJA2	O60884	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PLCG1	P19174	1290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	CAP2	P40123	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	NKG7	Q16617	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	HID1	Q8IV36	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	IMPDH2	P12268	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	RXRB	P28702	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	MAP7	Q14244	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HUWE1-208	ENST00000471676	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms