RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DOA	P06340	250 aa		21.39	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		21.39	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		21.38	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	TRPA1	O75762	1119 aa		21.38	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	SREBF2	Q12772	1141 aa		21.38	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		21.38	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		21.38	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D12	O60347	775 aa		21.37	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	GJA5	P36382	358 aa		21.37	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	ERO1B	Q86YB8	467 aa		21.37	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		21.37	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	PICK1	Q9NRD5	415 aa		21.37	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	PRKAB2	O43741	272 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K10	Q02779	954 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	APPBP2	Q92624	585 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	RILPL2	Q969X0	211 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	EVI5L	Q96CN4	794 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	ABHD8	Q96I13	439 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	SIPA1L1	O43166	1804 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		21.36	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	DOCK1	Q14185	1865 aa		21.35	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	TM4SF4	P48230	202 aa		21.35	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	TTC6	Q86TZ1	520 aa		21.35	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		21.35	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		21.35	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	OSBP2	Q969R2	916 aa		21.34	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	INHBE	P58166	350 aa		21.33	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		21.33	■■□□□ 1.01
USP19-210	ENST00000465902	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	IRF6	O14896	467 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	GTF2A2	P52657	109 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	PPAT	Q06203	517 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	PPIL2	Q13356	520 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		21.32	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	MYH8	P13535	1937 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	LAMB1	P07942	1786 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902		M0R2C6	588 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	GPAA1	O43292	621 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	APP	P05067	770 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	PDE4A	P27815	886 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	PLCD1	P51178	756 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	SNAPC2	Q13487	334 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CCL15	Q16663	113 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		21.31	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	PTPRA	P18433	802 aa		21.3	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CAP2	P40123	477 aa		21.3	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		21.3	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	IFNL1	Q8IU54	200 aa		21.3	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	GDF11	O95390	407 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CYP2D6	P10635	497 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CETP	P11597	493 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	EHD4	Q9H223	541 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC18	Q9H819	358 aa		21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	USP17L12	C9JPN9	530 aa		21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	USP17L21	D6R901	530 aa		21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D8	O95759	1140 aa		21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	GNAT2	P19087	354 aa		21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	DGKZ	Q13574	1117 aa		21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		21.28	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	21.27	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	ALDH1A1	P00352	501 aa		21.27	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	EVX2	Q03828	476 aa		21.27	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		21.27	■■□□□ 1
USP19-210	ENST00000465902	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	TRIM75P	A6NK02	468 aa		21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		21.26	■□□□□ 0.99
USP19-210	ENST00000465902	ASNS	P08243	561 aa		21.26	■□□□□ 0.99

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