RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456173.6

NEDD4L-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-208	ENST00000456173	SATB1	Q01826	763 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PSMD6	Q15008	389 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	FER	P16591	822 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MCM7	P33993	719 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PSMD2	Q13200	908 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	NNT	Q13423	1086 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	STAM	Q92783	540 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MSH6	P52701	1360 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CABP4	P57796	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ABCC5	O15440	1437 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PFKFB1	P16118	471 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PAK1	Q13153	545 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TESK2	Q96S53	571 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CREB3	O43889	395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZNF174	Q15697	407 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CUTA	O60888	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	ELF1	P32519	619 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CFAP157	Q5JU67	520 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	DES	P17661	470 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	NDUFA8	P51970	172 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CUL7	Q14999	1698 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	HSPA1L	P34931	641 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-208	ENST00000456173	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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