RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 NOX5Q96PH1 765 aa16.38■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 FANCLQ9NW38 375 aa16.38■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CDC23Q9UJX2 597 aa16.38■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 BMP15O95972 392 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ABCB6Q9NP58 842 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ATP10AO60312 1499 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 MLKLQ8NB16 471 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ZPR1O75312 459 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 VCX3BQ9H321 246 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 STAMQ92783 540 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PLVAPQ9BX97 442 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PTPRTO14522 1441 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 BICDL2A1A5D9 508 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF174Q15697 407 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.37■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CASP8Q14790 479 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 POSTNQ15063 836 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 USP28Q96RU2 1077 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 OPHN1O60890 802 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CETN1Q12798 172 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 G2E3Q7L622 706 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 VPS52Q8N1B4 723 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 IQUBQ8NA54 791 aa16.36■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 USP27XA6NNY8 438 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC151A5D8V7 595 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 DDX12PQ92771 950 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PRPHP41219 470 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF827Q17R98 1081 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 FYB2Q5VWT5 728 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PLA2R1Q13018 1463 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 MAGEA1P43355 309 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 DBN1Q16643 649 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 SBNO1A3KN83 1393 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 COG7P83436 770 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PTPROQ16827 1216 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ABCC1P33527 1531 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 GUCY2CP25092 1073 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.35■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PFKFB1P16118 471 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ATP5DP30049 168 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PAK1Q13153 545 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 KRT2P35908 639 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 MAP7Q14244 749 aa16.34■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PSMC4P43686 418 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 INSRP06213 1382 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 TNRQ92752 1358 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 FOXO3O43524 673 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 PLCB3Q01970 1234 aa16.33■□□□□ 0.21
PCNX1-202ENST00000439984 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 SRLQ86TD4 932 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 PREX2Q70Z35 1606 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 ZMYM3Q14202 1370 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 NDUFA8P51970 172 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 ST5P78524 1137 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 TSPY2A6NKD2 308 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 CYP2C19P33261 490 aa16.33■□□□□ 0.2
PCNX1-202ENST00000439984 TCHPQ9BT92 498 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms