RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439421.2

AL355500.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL355500.1, Length 297 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL355500.1-201ENST00000439421 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF384Q8TF68 577 aa15.19■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 MEIS3Q99687 375 aa15.19■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.19■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.18■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 XAGE2Q96GT9 111 aa15.18■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 SIPA1L1O43166 1804 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 HMGCS2P54868 508 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 TIMM10P62072 90 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 GSTO1P78417 241 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 TFCP2Q12800 502 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 SPP2Q13103 211 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 LRCH3Q96II8 777 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 STAP2Q9UGK3 403 aa15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 CEP290O15078 2479 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 PLXNB2O15031 1838 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 USP17L5A8MUK1 530 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 LDHCP07864 332 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 CAP2P40123 477 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 MTX1Q13505 466 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 GDF15Q99988 308 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 RPTORQ8N122 1335 aa15.16■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 SRGAP3O43295 1099 aa15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 BMP8BP34820 402 aa15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 PI16Q6UXB8 463 aa15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 SPATA5Q8NB90 893 aa15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
AL355500.1-201ENST00000439421 GNAI3P08754 354 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TRIM32Q13049 653 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TEX11Q8IYF3 940 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TRIB2Q92519 343 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 NBPF3Q9H094 633 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 RAI14Q9P0K7 980 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 GJD2Q9UKL4 321 aa15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 MTMR2Q13614 643 aa15.13■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 GPR153Q6NV75 609 aa15.13■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.13■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 MCAMP43121 646 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 GORABQ5T7V8 394 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 WDR18Q9BV38 432 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 FOCADQ5VW36 1801 aa15.12■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 SZT2Q5T011 3432 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 DLL1O00548 723 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 ASNSP08243 561 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 BACE1P56817 501 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 DNAJC18Q9H819 358 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 PFASO15067 1338 aa15.11■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 SYN1P17600 705 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 CYP2B6P20813 491 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 HERVK_113P62684 666 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 PDE3AQ14432 1141 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 LRIT3Q3SXY7 679 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 TDHQ8IZJ6 230 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 FLT1P17948 1338 aa15.1■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 C19orf81C9J6K1 198 aa15.09■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
AL355500.1-201ENST00000439421 PLCG2P16885 1265 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms