RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.55□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.55□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP17L12C9JPN9 530 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP17L21D6R901 530 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYO1BO43795 1136 aa11.54□□□□□ -0.56
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NT5C2P49902 561 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa11.54□□□□□ -0.56
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX11Q96FC9 970 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT23Q9C075 422 aa11.54□□□□□ -0.56
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